Ergenekon İddianamesi'nde terör örgütü üyesi Ali Yiğit'in işlediği suçlar ve hakkında talep edilen cezalar şöyle anlatıldı:
Şüpheli Ali YİĞİT'in Mehmet DEMİRTAŞ'ın yeğeni olduğu ve onun yanında çalıştığı; bombalan görmesine rağmen bir süre durumu yetkililere bildirmediği; ancak korktuğu için oturduğu evi boşalttıktan bir süre sonra babasını arayıp evi boşalttığını beyan edip babası tarafından Trabzon jandarmaya ihbar yapılması sonucu olayın ortaya çıktığı;
Ayrıca şüphelinin beyanlan sayesinde bombalann Oktay YILDIRIM'a ait olduğu yine bu şüpheli beyanlan sayesinde ZAFER (Kod) Muzaffer TEKİN ile Oktay YILDIRIM ve Mahmut ÖZTÜRK, Mehmet DEMİRTAŞ arasındaki örgütsel ilişkilerin ortaya çıkarıldığı anlaşıldığından, şüpheli hakkında örgüt üyeliği suçundan ek takipsizlik karan verildiği;
Şüphelinin eylemi suçu bildirmemek olarak gerçekleştiği, bu suçun da diğer delillerle irtibatlı olması sebebiyle birlikte görülmesinin usul ekonomisi ve delillerin birlikte değerlendirilmesinin zorunlu olduğu düşünüldüğünden tefrik edilmemiştir.
Şüpheli Ali YİĞİT'in eylemine uyan, TCK'nun 278/1 maddesi gereğince cezalandırılması talep edilmiştir.