Ergenekon İddianamesi'ne göre, Yusuf Berişik, Ergenekon Terör Örgütü'ne üye olmaksızın örgütünü amacını bilerek ve isteyerek örgütü yardımda bulundu.
Ergenekon iddianamesi bugün mahkemenin kabul etmesi ile iddianame kamuoyuna açıklandı. İddianamede, "Şüpheli Yusuf Beşirik'in İşçi Partisi Gençlik Örgütü'ne üye olduğunu, 1999 yılından beri Doğu Perinçek'in özel şoförlüğünü yaptığı, İşçi Partisi genel başkanı olan Doğu Perinçek'in kendine ait bir telefon kullanmamasına rağmen şüpheliye ait telefonu örgütsel içerikli görüşmelerinde kullandırdığı, uzun süredir Doğu Perinçek'in yanında olması sebebiyle Doğu Perinçek'in örgütsel içerikli tüm faaliyetlerini bilebilecek durumda olduğu, İşçi Partisi genel baskınlığı yapan bir şahsın telefonunun bulunmaması hayatın olağan akışına ters düşeceğinden, şüphelinin bilerek telefonunu Doğu Perinçek'e kullandırdığı, buradaki amacın işçi Partisi genel başkanı olan Doğu Perinçek'in illegal faaliyetlerinden ötürü teknik takibi atlatabilmek için bu şüpheliye ait telefonu örgütsel işlerde kullandığı anlaşılmış olmakla, aralarındaki ilişkinin işçi-patron ilişkisi olmadığı ve örgütsel konumu gereğince illegal olayları bildiği ve bilebilecek durumda olması, örgütsel içerikli toplantıların organizesi işlerini talimatlar doğrultusunda yaptığı, hususları göz önüne alındığında, Ergenekon Terör Örgütü'nün üyesi olmaksızın örgütün amacını bilerek ve isteyerek örgüte yardımda bulunduğu anlaşıldığından; Şüpheli Yusuf Beşirik'in Ergenekon terör örgütüne bilerek ve isteyerek yardım etmek eylemi nedeniyle, TCK'nun 314/3 ve 220/7 maddeleri yollaması ile TCK'nun 314/2 ve 3713 Sayılı Terörle Mücadele Kanunun 5. gereğince cezalandırılması talep edilmiştir." denildi.