Adalet Bakanlığı, Ergenekon Operasyonu'na ilişkin bilgi ve belgelerin Ulusal Yargı Ağı Projesi (UYAP) aracılığıyla, soruşturmayı yürüten Cumhuriyet savcıları dışında hiçbir bakanlık yetkilisi tarafından kontrolünün mümkün olmadığını bildirdi.
Bakanlık, yaptığı yazılı açıklamayla, Ergenekon soruşturması ve UYAP'a yönelik iddialara yanıt verdi. Adalet Bakanlığı'ndan yapılan açıklamada şöyle denildi: "İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından yürütülen Ergenekon Örgütü soruşturmasıyla ilgili bilgi ve belgelerin UYAP aracılığıyla Adalet Bakanlığı yetkilileri tarafından öğrenilebileceği iddialarının gündeme getirilmesi nedeniyle açıklama yapılmıştır.
İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığı'nca yürütülen Ergenekon Örgütü soruşturmasıyla ilgili bilgi ve belgelerin UYAP aracılığıyla soruşturmayı yürüten Cumhuriyet savcıları dışında hiçbir bakanlık yetkilisi, hakim, savcı ya da bilgi işlem merkezi personelince kontrol edilmesi ve görülmesi mümkün değildir.
UYAP, zaman kaybetmeden adaletin yerine getirilerek vatandaşın mağdur olmasını engellemek, yargı sisteminin işleyişinin güvenilirliğini ve doğruluğunu koruyarak sisteme hız kazandırmak amacıyla kurulmuş, teknolojinin ulaştığı tüm güvenlik tedbirlerinin uygulandığı bir bilişim sistemidir."